L'ufficio è diviso in cinque sezioni, ognuna delle quali persegue determinate fattispecie di reato.
Le sezioni sono le seguenti:
- Prima Sezione - Sicurezza Ambientale, del Territorio e dei Luoghi di Lavoro;
- Seconda Sezione - Reati contro la Pubblica Amministrazione;
- Terza Sezione - Criminalità Economica;
- Quarta Sezione - Fasce Deboli;
- Quinta Sezione- Criminalità Predatoria.
Ad ogni sezione è associata la relativa segreteria sezionale.